والقبة هي عبارة عن مبنى مربّع مقام على أربعة أركان، تعلوه قبّة ضحلة على الطراز العثماني، وفي الجهات الأربع ثماني نوافذ مستطيلة الشكل. حيث يقع في واجهة المبنى الشرقيّة باب صغير يعلوه نقش يحمل اسم وتاريخ المبنى. ويوجد بداخل هذه القبة من جهة القبلة محراب من حجر كلسي ملكي فيه حنية حجريّة، وتحت مبنى قبة الخليلي يوجد مبنى سفلي يسمى مغارة الأرواح، يتوصل إليه من خلال سلم حجري مقطوع من الصخر، وهذا الكهف قليل التهوية عديم النور ولا يستعمل. وتستعمل القبة اليوم كمكتب للجنة إعمار المسجد الأقصى المبارك

The dome is a square building built on four corners, surmounted by a shallow dome in the Ottoman style, and on the four sides, there are eight rectangular windows. On the eastern facade of the building, there is a small door with an inscription above it bearing the name and date of the building. Inside this dome, facing the direction of the Qibla, there is a niche made of royal limestone with a stone apse. Under the building of the Al-Khalili Dome, there is a lower building called the Cave of Spirits, which can be reached through a stone staircase cut from the rock. This cave has little ventilation, lacks light, and is not used. Today, the dome is used as an office for the Restoration Committee of the Blessed Al-Aqsa Masjid.